Referát  vnútornej prevádzky zabezpečuje:

• chod úradu v súlade s vnútornými smernicami a rozpočtovými pravidlami
• zabezpečuje materiálno-technické vybavenie úradu v zmysle platnej legislatívy
• spravuje objekty, ktoré Úrad KSK užíva na plnenie úloh
• zabezpečuje evidenciu faktúr a ich adjustáciu v zmysle zákona o účtovníctve
• zabezpečuje evidenciu pošty, archiváciu materiálov a dbá o dodržiavanie registratúrneho poriadku KSK (zákon NR SR č. 395/2002 Z. z.)
• riadi, kontroluje a usmerňuje úsek  autoprevádzky, jej využívanie a hodnotenie
• zabezpečuje evidenciu  a odpisovanie nehnuteľného a hnuteľného majetku využívaného Úradom KSK
• vedie evidenciu objednávok a centrálnu evidenciu zmlúv za úrad KSK vrátane zabezpečenia  predbežnej a priebežnej kontroly ako aj verejného  obstarania podlimitných prác, tovarov a služieb

Referát investícií zabezpečuje:

• výkon investorskej funkcie u stavieb financovaných z rozpočtu KSK a iných zdrojov (príprava a realizácia investičnej výstavby)
• metodické usmerňovanie výkonu investičnej činnosti v rozpočtových a príspevkových organizáciách KSK
• predkladanie návrhov na rozpočet a rozpis kapitálových výdavkov
• inžiniersku činnosť pre potreby KSK
• zastupovanie KSK v konaní podľa zákona č. 50/1976 Zb. o územnom plánovaní a stavebnom poriadku (stavebný zákon) v platnom znení
• plán potrieb na verejné obstaranie tovarov, služieb a stavebných prác
• vypracovanie podkladov pre verejné obstarávanie a proces verejného obstarávania pre potreby investičnej činnosti v rámci investičného referátu